Vi que hay soluciones como usar un puente ssh, ftp, entre otros. Pero ninguno no me simpatizaban... :P
Y, tratando de encontrar una ruta que NetBeans aceptara me encontré con GVFS y magia!
Entonces para trabajar con proyectos remotos sólo debes asignar el directorio de trabajo así:
~/.gvfs/recurso/proyecto
¡Fácil!
NOTA: Deben abrir primero el directorio remoto antes, si no, no aparecerá en ~/.gvfs
Otra solución, crear un link (Actualización)
ln -s ~/.gvfs/recurso/proyecto nombre_proyecto
Se creará un link en el directorio actual, y podrás usarlo en netbeans o cualquier ide o editor que uses.
