La solución es simple, pero espero que a alguno le sirva. También puedo decir que esta solución puede extenderse a cualquier tipo de archivo.
Primero debemos crear un nuevo archivo con el contenido que deseamos en el PHTML (Yo creé un nuevo PHP Web Page...).
Luego copiamos el código generado y creamos un archivo nuevo vacío (Empty file...). El nombre que elijamos será el de nuestro template, por ejemplo yo usé PHTML FILE.phtml
Luego pegamos el código copiado. Les Recuerdo que es posible editar a su antojo este código antes de guardarlo.
Terminado lo anterior guardamos este archivo como template y listo! ya podemos crear cuantos archivos PHTML queramos (Por primera vez estará en Other...).
